DNA methylation은 미생물의 주된 epigenetic regulation으로 염기서열 변화 없이 virulence, cell cycle, defense system에 관여한다. Metagenomics를 통해 해양 및 장내 microbiome에서 DNA methylation 분포 패턴을 분석하는 연구를 진행하고 있다.