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New Metagenomic Approaches

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우리나라 동해부터 배링해엽까지 해양 10개 지점(약 8,000km)의 바닷물을 수집하여 미생물이 점진적인 환경변화로부터 어떻게 변화되며 이들의 유전자가 어떤 영향을 받는지 분석 중에 있음.

이를 확인하기에 Genotyping-by-Sequencing (GBS) 이라는 빠르고 효율적인 새로운 메타 유전체 분석 방법을 적용하고 있으며 환경변화에 따른 single nucleotide variations (SNVs) 패턴이 단백질 변이까지 조절하는지 연구하고 있음.

 

 

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Root Microbiome

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식물 삼출물(exudate)은 식물 뿌리를 통해 근권(rhizosphere)으로 유입되는데 vesicle-associated membrane protein (VAMP) 단백질은 삼출물 분비 조절을 함. 근권으로 유입된 삼출물은 근권 미생물과의 상호작용을 통해 식물의 생장과 면역 증진 등을 촉진함.

메타유전체 기법을 이용하여 VAMP 뮤턴트(mutant)의 근권 미생물 군집을 비교하고 유용 미생물 자원 발굴을 위한 연구 과제 수행중.

 

 

 

 

 

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Antibiotic Resistant Genes in Fresh Water

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한국 4대강 내 하수처리시설에서 상류, 방류지점 (하수처리 후 물이 흘러 나오는 지점), 하류의 담수 샘플 메타유전체 분석을 통하여 각 지점의 항생제 내성 유전자를 정량적으로 탐색하고 그 차이를 연구함.

방류지점에서 항생제 내성 유전자의 종류와 양이 상대적으로 많이 존재하지만 방류수의 항생제 내성 유전자는 하류로 가면서 희석되어 하류에는 큰 영향을 미치지 않는 다는 것을 확인하고 추후 연구 중에 있음.